Elektroforeza całego plazmidy daje nam najwięcej informacji o obecności lub braku dodatkowego fragmentu w plazmidzie
Trawienie plazmidu przed elektroforezą jest korzystne, ale nie informuje nas o obecności konkretnej stawki w plazmidzie
Płytka agarowa z koloniami może być przekopiowana na błonę nitrocelulozową poprzez położenie krążka takiej błony na szalce. Fragmenty kolonii zostaną na błonie i stworzą replikę niektórych klonów. Później kolonie się denaturuje i utrwala DNA oraz hybrydyzuje.
Płytka agarowa z koloniami może być przekopiowana na błonę nitrocelulozową poprzez położenie krążka takiej błony na szalce. Fragmenty kolonii zostaną na błonie i stworzą replikę klonów. Później kolonie się denaturuje i utrwala DNA oraz hybrydyzuje do DNA wyznakowanego izotopem radioaktywnym lub barwnikiem fluorescencyjnym. Nie jest możliwe jednak otrzymania dokładnego położenia hybrydyzacji. Później porównuje się miejsce hybrydyzacji z miejscem w szalce w macierzystej kolonii i można zidentyfikować klon zawierający wstawkę o oczekiwanej sekwencji.
Płytka agarowa z koloniami może być przekopiowana na błonę nitrocelulozową poprzez położenie krążka takiej błony na szalce. Fragmenty kolonii zostaną na błonie i stworzą replikę klonów. Po wzrostu kolonii i zdjęciu filtra z agaru kolonie się denaturuje, przemywa i utrwala DNA oraz hybrydyzuje do 2 niciowego DNA. Później porównuje się miejsce hybrydyzacji z miejscem w szalce w macierzystej kolonii i można zidentyfikować klon zawierający wstawkę o oczekiwanej sekwencji.
Fragmenty kolonii bakteryjnej zostają na błonie tworząc replikę wszystkich klonów. Później kolonie się denaturuje, przemywa i utrwala DNA oraz hybrydyzuje do 1-nicieniowego DNA
Jeżeli wykorzysta się startery specyficzne dla poszukiwanej stawki to w wyniku reakcji otrzyma się informację o obecności każdej wstawki i jej orientacyjnej długości
Jeżeli wykorzysta się startery uniwersalne to pozwalają one na identyfikację poszukiwanej sekwencji w badanych koloniach
Ponieważ ekspresyjny wektor fagowy nie zawiera fragmentu beta-galaktozy z promotorem i w wyniku wklonowania nie tworzy się gen fuzyjny zawierający sekwencję wstawki
Ponieważ po lizie bakterii uwolnione w łysinkach fagowych białka są bezpośrednio dostępne do detekcji
Ponieważ po infekcji bakterii cząsteczkami fagowymi pojawia się liza bakterii ujawniająca się w postaci łysinek na murawie bakteryjnej i występują w niej jedynie białka bakteryjne.
